Contact maps

The contact map plots presented below illustrate the performance (precision) difference between raw methods (PSICOV and DCA) and PconsC. Each contact map has been generated based on the alignment produced by jackhmmer at e-value of 10e-4.

Precision (PPV) estimates on the contact maps have been computed for the closest heavy atom contacts, with positive contacts less than 6 A apart and negative ones - more than 9 AA apart. No short-range interactions are considered. To be included on a contact map and in PPV calculations, contacts need to be at least 5 residues apart (i.e. (i, i+5)).

Training

1COZ:A psicov mfDCA plmDCA

1HZX:A psicov mfDCA plmDCA

1L1S:A psicov mfDCA plmDCA

1LDI:A psicov mfDCA plmDCA

1LRI:A psicov mfDCA plmDCA

1OCC:C psicov mfDCA plmDCA

1OKC:A psicov mfDCA plmDCA

1PP9:B psicov mfDCA plmDCA

1QOY:A psicov mfDCA plmDCA

1RTQ:A psicov mfDCA plmDCA

1VJN:A psicov mfDCA plmDCA

1XQF:A psicov mfDCA plmDCA

2A65:A psicov mfDCA plmDCA

2AMJ:A psicov mfDCA plmDCA

2D2C:N psicov mfDCA plmDCA

2FEE:B psicov mfDCA plmDCA

2KR6:A psicov mfDCA plmDCA

2NQ2:A psicov mfDCA plmDCA

2NR9:A psicov mfDCA plmDCA

2O72:A psicov mfDCA plmDCA

2OA5:A psicov mfDCA plmDCA

2ONK:C psicov mfDCA plmDCA

2OPI:A psicov mfDCA plmDCA

2Q7R:A psicov mfDCA plmDCA

2R4Q:A psicov mfDCA plmDCA

2WIT:A psicov mfDCA plmDCA

2XQ2:A psicov mfDCA plmDCA

3A2E:A psicov mfDCA plmDCA

3BY8:A psicov mfDCA plmDCA

3ELN:A psicov mfDCA plmDCA

3GUV:A psicov mfDCA plmDCA

3H90:A psicov mfDCA plmDCA

3M71:A psicov mfDCA plmDCA

3MKT:A psicov mfDCA plmDCA

3NED:A psicov mfDCA plmDCA

3PJZ:A psicov mfDCA plmDCA

3QE7:A psicov mfDCA plmDCA

3QNQ:A psicov mfDCA plmDCA

3RKO:N psicov mfDCA plmDCA

3RWA:A psicov mfDCA plmDCA

3TGI:E psicov mfDCA plmDCA

3ZUX:A psicov mfDCA plmDCA

4IEJ:A psicov mfDCA plmDCA

Testing

1A3A:A psicov mfDCA plmDCA

1A6M:A psicov mfDCA plmDCA

1A70:A psicov mfDCA plmDCA

1AAP:A psicov mfDCA plmDCA

1ABA:A psicov mfDCA plmDCA

1AG6:A psicov mfDCA plmDCA

1AOE:A psicov mfDCA plmDCA

1ATL:A psicov mfDCA plmDCA

1ATZ:A psicov mfDCA plmDCA

1AVS:A psicov mfDCA plmDCA

1BDO:A psicov mfDCA plmDCA

1BEB:A psicov mfDCA plmDCA

1BEH:A psicov mfDCA plmDCA

1BKR:A psicov mfDCA plmDCA

1BRF:A psicov mfDCA plmDCA

1BSG:A psicov mfDCA plmDCA

1C44:A psicov mfDCA plmDCA

1C52:A psicov mfDCA plmDCA

1C9O:A psicov mfDCA plmDCA

1CC8:A psicov mfDCA plmDCA

1CHD:A psicov mfDCA plmDCA

1CJW:A psicov mfDCA plmDCA

1CKE:A psicov mfDCA plmDCA

1CTF:A psicov mfDCA plmDCA

1CXY:A psicov mfDCA plmDCA

1CZN:A psicov mfDCA plmDCA

1D0Q:A psicov mfDCA plmDCA

1D1Q:A psicov mfDCA plmDCA

1D4O:A psicov mfDCA plmDCA

1DBX:A psicov mfDCA plmDCA

1DIX:A psicov mfDCA plmDCA

1DLW:A psicov mfDCA plmDCA

1DMG:A psicov mfDCA plmDCA

1DQG:A psicov mfDCA plmDCA

1DSX:A psicov mfDCA plmDCA

1EAZ:A psicov mfDCA plmDCA

1EJ0:A psicov mfDCA plmDCA

1EJ8:A psicov mfDCA plmDCA

1EK0:A psicov mfDCA plmDCA

1F6B:A psicov mfDCA plmDCA

1FCY:A psicov mfDCA plmDCA

1FK5:A psicov mfDCA plmDCA

1FL0:A psicov mfDCA plmDCA

1FNA:A psicov mfDCA plmDCA

1FQT:A psicov mfDCA plmDCA

1FVG:A psicov mfDCA plmDCA

1FVK:A psicov mfDCA plmDCA

1FX2:A psicov mfDCA plmDCA

1G2R:A psicov mfDCA plmDCA

1G9O:A psicov mfDCA plmDCA

1GBS:A psicov mfDCA plmDCA

1GMI:A psicov mfDCA plmDCA

1GMX:A psicov mfDCA plmDCA

1GUU:A psicov mfDCA plmDCA

1GZ2:A psicov mfDCA plmDCA

1GZC:A psicov mfDCA plmDCA

1H0P:A psicov mfDCA plmDCA

1H2E:A psicov mfDCA plmDCA

1H4X:A psicov mfDCA plmDCA

1H98:A psicov mfDCA plmDCA

1HDO:A psicov mfDCA plmDCA

1HFC:A psicov mfDCA plmDCA

1HH8:A psicov mfDCA plmDCA

1HTW:A psicov mfDCA plmDCA

1HXN:A psicov mfDCA plmDCA

1I1J:A psicov mfDCA plmDCA

1I1N:A psicov mfDCA plmDCA

1I4J:A psicov mfDCA plmDCA

1I58:A psicov mfDCA plmDCA

1I5G:A psicov mfDCA plmDCA

1I71:A psicov mfDCA plmDCA

1IHZ:A psicov mfDCA plmDCA

1IIB:A psicov mfDCA plmDCA

1IM5:A psicov mfDCA plmDCA

1IWD:A psicov mfDCA plmDCA

1J3A:A psicov mfDCA plmDCA

1JBE:A psicov mfDCA plmDCA

1JBK:A psicov mfDCA plmDCA

1JFU:A psicov mfDCA plmDCA

1JFX:A psicov mfDCA plmDCA

1JKX:A psicov mfDCA plmDCA

1JL1:A psicov mfDCA plmDCA

1JO0:A psicov mfDCA plmDCA

1JO8:A psicov mfDCA plmDCA

1JOS:A psicov mfDCA plmDCA

1JVW:A psicov mfDCA plmDCA

1JWQ:A psicov mfDCA plmDCA

1JYH:A psicov mfDCA plmDCA

1K6K:A psicov mfDCA plmDCA

1K7C:A psicov mfDCA plmDCA

1K7J:A psicov mfDCA plmDCA

1KID:A psicov mfDCA plmDCA

1KQ6:A psicov mfDCA plmDCA

1KQR:A psicov mfDCA plmDCA

1KTG:A psicov mfDCA plmDCA

1KU3:A psicov mfDCA plmDCA

1KW4:A psicov mfDCA plmDCA

1LM4:A psicov mfDCA plmDCA

1LO7:A psicov mfDCA plmDCA

1LPY:A psicov mfDCA plmDCA

1M4J:A psicov mfDCA plmDCA

1M8A:A psicov mfDCA plmDCA

1MK0:A psicov mfDCA plmDCA

1MUG:A psicov mfDCA plmDCA

1NB9:A psicov mfDCA plmDCA

1NE2:A psicov mfDCA plmDCA

1NPS:A psicov mfDCA plmDCA

1NRV:A psicov mfDCA plmDCA

1NY1:A psicov mfDCA plmDCA

1O1Z:A psicov mfDCA plmDCA

1P90:A psicov mfDCA plmDCA

1PCH:A psicov mfDCA plmDCA

1PKO:A psicov mfDCA plmDCA

1QF9:A psicov mfDCA plmDCA

1QJP:A psicov mfDCA plmDCA

1QL0:A psicov mfDCA plmDCA

1R26:A psicov mfDCA plmDCA

1ROA:A psicov mfDCA plmDCA

1RW1:A psicov mfDCA plmDCA

1RW7:A psicov mfDCA plmDCA

1RYB:A psicov mfDCA plmDCA

1SMX:A psicov mfDCA plmDCA

1SVY:A psicov mfDCA plmDCA

1T8K:A psicov mfDCA plmDCA

1TIF:A psicov mfDCA plmDCA

1TQG:A psicov mfDCA plmDCA

1TQH:A psicov mfDCA plmDCA

1TZV:A psicov mfDCA plmDCA

1VFY:A psicov mfDCA plmDCA

1VHU:A psicov mfDCA plmDCA

1VJK:A psicov mfDCA plmDCA

1VMB:A psicov mfDCA plmDCA

1VP6:A psicov mfDCA plmDCA

1W0H:A psicov mfDCA plmDCA

1WHI:A psicov mfDCA plmDCA

1WJX:A psicov mfDCA plmDCA

1WKC:A psicov mfDCA plmDCA

1XDZ:A psicov mfDCA plmDCA

1XFF:A psicov mfDCA plmDCA

1XKR:A psicov mfDCA plmDCA

2ARC:A psicov mfDCA plmDCA

2CUA:A psicov mfDCA plmDCA

2HS1:A psicov mfDCA plmDCA

2MHR:A psicov mfDCA plmDCA

2PHY:A psicov mfDCA plmDCA

2TPS:A psicov mfDCA plmDCA

2VXN:A psicov mfDCA plmDCA

3BOR:A psicov mfDCA plmDCA

3DQG:A psicov mfDCA plmDCA

5PTP:A psicov mfDCA plmDCA